La marca gráfica de la Universidad Pública de Navarra consiste en las iniciales del nombre de la institución "upna" en minúsculas. El uso del color negro para las dos primeras letras "up" y del rojo para las dos últimas, "na" pretende combinar los atributos asociados a dichos colores (sobriedad y energía y vitalidad). En concreto, el tono de rojo elegido se trata del denominado "foral", correspondiente al pantone 485C.

En cuanto a la tipografía del acrónimo, se ha elegido la Helvética Médium, mientras que para la leyenda "Universidad Pública de Navarra" que figura en castellano, euskera o inglés, se ha elegido el tipo de letra Times New Roman.

Además, la colocación de las dos últimas letras "na" en un plano más elevado quiere transmitir la idea de que la Universidad Pública de Navarra se encuentra en constante movimiento, proyectada hacia la sociedad y dedicada a crear futuro. Asimismo, con esta nueva marca, la Universidad pretende dejar patente su carácter y proyección internacional.